우리 연구소에거 개발하고 있는 소프트웨어 중에 ChIPS라는 것이 있다. Chemical Information Power System의 약자로서 화합물의 많은 정보들을 직접 관리할 수 있도록 해 주는 화합물 데이터베이스 프로그램이다.
사실 이 외에도 많은 프로그램들이 이미 존재하고 있고, 특히 제약회사 같은 곳에서는 많은 돈을 들여 이런 어플리케이션을 개발해서 쓰고 있기도 하다. 정작 문제는 최근 들어 합성 기술이 발전하고 화합물 라이브러리 회사가 많아지면서 합성하지 않고도 다양한 화합물을 구매할 수 있는 기회가 많이 늘어났기 때문에 큰 제약회사가 아니라고 해도 많은 수의 화합물을 보유할 수 있게 되었다는데 있다. 이런 경우에 항상 비싼 소프트웨어를 사용할 수 있는 것은 아니니 말이다.
최근에 open source로 많은 프로그램들이 공개되고 있는데, 이런 화합물 데이터베이스도 예외가 아니어서, PCC라는 소프트웨어가 무료로 소스가 공개되었다. 이 소프트웨어의 장점은 다양한 데이터 소스를 지원한다는 점인데, csv와 같은 text, Excel, Access, MySQL, Oracle 등의 일반적인 데이터베이스를 지원하고, 이외에 1.1 버전에서부터는 sdf 읽기를 지원한다. 그리고 SMILES를 지원해서 이를 이용한 구조 검색을 할 수 있다.
데이터베이스 어플리케이션이라고 하기에는 좀 최적화가 덜 되어 있는듯, 5000개 정도까지 사용을 할 수 있다고 되어 있는 점은 아쉬운 점이다. 주로 자바를 이용해서 프로그램 되어 있고, hyleos에서 나온 ChemViewX라는 프로그램을 이용해서 구조를 보여주는 것으로 보인다.
나는 이 프로그램의 1.0 버전을 받아서 테스트를 한 번 했었는데, 그렇게 인상적이지 않아서 금방 잊어버리고 있었다. 그런데, 얼마 전에 1.1 버전이 나오면서 이메일이 한 통 왔다. 사용해 본 소감을 물어보면서 전화번호와 시간을 알려주면 직접 전화를 할 테니 이야기를 좀 해 달라는 내용이었다. 사실, 이윤을 내야 하는 회사에서 이런 소프트웨어를 무료로 공개하고 이렇게 정성을 들여 관리를 하는 것이 쉬운 일은 아닌데 대단하다는 생각이 들었고, 한편으로는 이런 것이 실제 회사의 이윤을 높이는데 기여할 수 있다는 점에서 지금 하고 있는 일을 잘 마무리해야겠다는 생각도 들었다.
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